李镇教授荣获CCF-腾讯2019年度犀牛鸟科研基金
01 奖项简介
中国计算机大会是由中国计算机学会举办的,中国计算机领域级别最高、规模最大的学术盛会。CCF-腾讯犀牛鸟基金于2013年由腾讯公司和中国计算机学会(CCF)共同发起,致力于面向海内外青年学者搭建产学研合作及学术交流的平台。7年来,犀牛鸟基金为全球范围内极具创新力的青年学者提供了解产业真实问题,接触业务实际需求的机会,并通过连接青年学者与企业研发团队的产学科研合作,推动双方学术影响力的提升及应用成果的落地,为科技自主研发的探索和创新储备能量。值得一提的是,理工学院的黄铠教授也曾于2005年获得过CCF海外杰出贡献奖,理工学院黄锐教授也曾于2018年获得CCF科学技术奖自然科学二等奖。
截至目前,CCF-腾讯犀牛鸟基金累计收到来自全球176所高校和科研院所的934位青年学者提交的申请方案,累积资助科研基金项目115项,创意基金项目93项。基金获得者通过与腾讯业务团队的深度合作,共发表高水平学术论文超过600篇,申请国内外专利超过200余项,充分体现了青年学者研究视野的前瞻性、跨领域的融合性及创新科研的引领性。此外,通过与产业应用研发场景中实际问题相结合,青年学者在与企业的合作过程中,有机会将研究成果实现落地应用转化,从而达到学术研究与产业应用工程实践之间的平衡有效连接。
02 项目介绍
从氨基酸序列准确地预测蛋白质结构及三维折叠,是计算生物学中最具挑战性的任务之一,也为大大缩减药物设计时间和实验成本提供了可行的解决方案。本项目旨在利用深度学习进行从头开始的蛋白质结构预测和结构设计,基于前期工作,主要研究如下四个子课题。1)基于海量氨基酸序列的预训练模型学习,并将预训练模型应用于蛋白质二级结构及其他属性预测;2)基于网络搜索的蛋白质邻接图预测及距离图预测,并将预测邻接图及距离图结合蒙特卡洛算法或者演化算法进行从头开始的三维折叠预测;3)基于三维视觉深度学习的蛋白质结合区预测,从而指导制药设计;4)基于共演化信息矩阵和演化信息生成的蛋白质设计。基于自编码生成模型生成共演化信息和演化特征,并基于蒙特卡洛采样得到相对应的氨基酸序列,构成蛋白质结构预测与结构设计的闭环系统。
03 李镇教授简介
李镇教授分别在2011年和2014年于中山大学获得学士和硕士学位,在2018年于香港大学获得博士学位。他先后在2016年和2018年前往芝加哥大学、丰田芝加哥研究院进行访问学者研究工作。他于2018年9月加入香港中文大学(深圳)理工学院担任研究助理教授,并于深圳市大数据研究院担任研究科学家。他的研究兴趣主要是利用深度学习进行蛋白质结构预测,与类脑芯片结合的网络压缩与网络搜索,多模态与小样本下的医学数据分析。欢迎对于人工智能、计算生物学等交叉学科感兴趣的同学加入课题组进行研究学习,表现优异的可以推荐至腾讯AI Lab及商汤进行研究工作。